Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col9a1Q05722 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms