Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cdk18Q04899 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk18Q04899 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms