Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Sox13Q04891 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms