Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top1Q04750 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top1Q04750 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Top1Q04750 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Top1Q04750 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top1Q04750 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms