Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smpd1Q04519 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms