Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms