Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax5Q02650 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms