Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pdcd1Q02242 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcd1Q02242 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms