Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VcpQ01853 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VcpQ01853 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VcpQ01853 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VcpQ01853 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
VcpQ01853 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VcpQ01853 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VcpQ01853 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VcpQ01853 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VcpQ01853 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VcpQ01853 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms