Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms