Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Top2aQ01320 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Top2aQ01320 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms