Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EgfrQ01279 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms