Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbp1Q00915 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms