Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Serpina1cQ00896 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms