Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms