Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx2Q00262 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx2Q00262 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms