Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psmb4P99026 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.8 ms