Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IhhP97812 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IhhP97812 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IhhP97812 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IhhP97812 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IhhP97812 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IhhP97812 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IhhP97812 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IhhP97812 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IhhP97812 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IhhP97812 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IhhP97812 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IhhP97812 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IhhP97812 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IhhP97812 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IhhP97812 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IhhP97812 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IhhP97812 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IhhP97812 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IhhP97812 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IhhP97812 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IhhP97812 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IhhP97812 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IhhP97812 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IhhP97812 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IhhP97812 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IhhP97812 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IhhP97812 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IhhP97812 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IhhP97812 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IhhP97812 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IhhP97812 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IhhP97812 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IhhP97812 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IhhP97812 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IhhP97812 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IhhP97812 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IhhP97812 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IhhP97812 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IhhP97812 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IhhP97812 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IhhP97812 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IhhP97812 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IhhP97812 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IhhP97812 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IhhP97812 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IhhP97812 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IhhP97812 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IhhP97812 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IhhP97812 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IhhP97812 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IhhP97812 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IhhP97812 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IhhP97812 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IhhP97812 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IhhP97812 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IhhP97812 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IhhP97812 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IhhP97812 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IhhP97812 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IhhP97812 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IhhP97812 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IhhP97812 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IhhP97812 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IhhP97812 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IhhP97812 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IhhP97812 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IhhP97812 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IhhP97812 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IhhP97812 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IhhP97812 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IhhP97812 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IhhP97812 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IhhP97812 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IhhP97812 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IhhP97812 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IhhP97812 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IhhP97812 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IhhP97812 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IhhP97812 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IhhP97812 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
IhhP97812 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IhhP97812 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IhhP97812 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IhhP97812 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IhhP97812 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IhhP97812 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IhhP97812 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IhhP97812 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IhhP97812 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IhhP97812 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IhhP97812 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IhhP97812 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IhhP97812 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IhhP97812 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IhhP97812 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IhhP97812 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IhhP97812 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IhhP97812 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IhhP97812 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms