Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smn1P97801 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smn1P97801 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smn1P97801 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smn1P97801 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smn1P97801 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smn1P97801 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smn1P97801 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smn1P97801 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smn1P97801 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smn1P97801 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smn1P97801 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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