Protein–RNA interactions for Protein: P97789

Xrn1, 5'-3' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn1P97789 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Xrn1P97789 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Xrn1P97789 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Xrn1P97789 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Xrn1P97789 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Xrn1P97789 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Xrn1P97789 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xrn1P97789 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Xrn1P97789 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xrn1P97789 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xrn1P97789 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xrn1P97789 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xrn1P97789 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xrn1P97789 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xrn1P97789 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xrn1P97789 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xrn1P97789 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xrn1P97789 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xrn1P97789 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xrn1P97789 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Xrn1P97789 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xrn1P97789 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xrn1P97789 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xrn1P97789 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xrn1P97789 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xrn1P97789 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xrn1P97789 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xrn1P97789 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xrn1P97789 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xrn1P97789 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Xrn1P97789 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xrn1P97789 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xrn1P97789 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Xrn1P97789 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xrn1P97789 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xrn1P97789 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xrn1P97789 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xrn1P97789 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xrn1P97789 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xrn1P97789 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xrn1P97789 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms