Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited1P97769 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited1P97769 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited1P97769 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited1P97769 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited1P97769 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited1P97769 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited1P97769 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited1P97769 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited1P97769 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited1P97769 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited1P97769 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited1P97769 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited1P97769 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cited1P97769 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cited1P97769 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cited1P97769 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cited1P97769 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Cited1P97769 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cited1P97769 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited1P97769 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited1P97769 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited1P97769 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cited1P97769 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cited1P97769 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cited1P97769 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cited1P97769 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cited1P97769 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms