Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pitx2P97474 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms