Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tarbp2P97473 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms