Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cmklr1P97468 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cmklr1P97468 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cmklr1P97468 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cmklr1P97468 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cmklr1P97468 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Cmklr1P97468 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Cmklr1P97468 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Cmklr1P97468 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Cmklr1P97468 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Cmklr1P97468 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Cmklr1P97468 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Cmklr1P97468 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Cmklr1P97468 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Cmklr1P97468 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cmklr1P97468 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Cmklr1P97468 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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