Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp1P97350 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp1P97350 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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