Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vgll3P85442 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms