Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx2P80206 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx2P80206 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx2P80206 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Otx2P80206 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx2P80206 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms