Protein–RNA interactions for Protein: P70704

Atp8a1, Phospholipid-transporting ATPase IA, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8a1P70704 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp8a1P70704 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp8a1P70704 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp8a1P70704 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp8a1P70704 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp8a1P70704 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8a1P70704 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8a1P70704 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8a1P70704 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8a1P70704 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8a1P70704 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8a1P70704 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8a1P70704 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8a1P70704 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8a1P70704 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8a1P70704 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8a1P70704 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8a1P70704 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8a1P70704 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8a1P70704 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8a1P70704 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8a1P70704 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8a1P70704 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8a1P70704 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8a1P70704 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8a1P70704 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8a1P70704 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms