Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr1bP70700 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms