Protein–RNA interactions for Protein: P70698

Ctps1, CTP synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctps1P70698 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctps1P70698 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctps1P70698 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.7 ms