Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ldb1P70662 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms