Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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