Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeboxP70368 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeboxP70368 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeboxP70368 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeboxP70368 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SeboxP70368 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SeboxP70368 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SeboxP70368 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SeboxP70368 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SeboxP70368 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SeboxP70368 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms