Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Smad1P70340 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad1P70340 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad1P70340 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad1P70340 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad1P70340 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad1P70340 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad1P70340 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad1P70340 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad1P70340 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad1P70340 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad1P70340 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms