Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NficP70255 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NficP70255 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NficP70255 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NficP70255 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NficP70255 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NficP70255 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NficP70255 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NficP70255 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NficP70255 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NficP70255 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NficP70255 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NficP70255 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NficP70255 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NficP70255 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NficP70255 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NficP70255 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NficP70255 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NficP70255 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NficP70255 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NficP70255 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NficP70255 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NficP70255 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NficP70255 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NficP70255 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NficP70255 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NficP70255 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NficP70255 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NficP70255 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NficP70255 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NficP70255 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NficP70255 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NficP70255 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NficP70255 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NficP70255 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NficP70255 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NficP70255 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NficP70255 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NficP70255 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NficP70255 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NficP70255 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NficP70255 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NficP70255 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NficP70255 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NficP70255 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NficP70255 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NficP70255 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NficP70255 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NficP70255 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NficP70255 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NficP70255 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NficP70255 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NficP70255 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NficP70255 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NficP70255 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NficP70255 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NficP70255 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NficP70255 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NficP70255 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NficP70255 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NficP70255 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NficP70255 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NficP70255 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NficP70255 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NficP70255 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NficP70255 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NficP70255 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NficP70255 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NficP70255 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NficP70255 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NficP70255 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NficP70255 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NficP70255 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NficP70255 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NficP70255 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NficP70255 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NficP70255 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NficP70255 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NficP70255 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NficP70255 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NficP70255 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NficP70255 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NficP70255 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NficP70255 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NficP70255 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NficP70255 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NficP70255 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NficP70255 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NficP70255 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NficP70255 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NficP70255 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NficP70255 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NficP70255 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NficP70255 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NficP70255 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NficP70255 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NficP70255 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NficP70255 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NficP70255 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NficP70255 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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