Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf5P70191 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf5P70191 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf5P70191 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf5P70191 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf5P70191 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf5P70191 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms