Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SbdsP70122 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SbdsP70122 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SbdsP70122 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SbdsP70122 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SbdsP70122 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbdsP70122 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbdsP70122 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SbdsP70122 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.8 ms