Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms