Protein–RNA interactions for Protein: P63006

Lhx1, LIM/homeobox protein Lhx1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx1P63006 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx1P63006 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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