Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vsnl1P62761 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsnl1P62761 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms