Protein–RNA interactions for Protein: P62748

Hpcal1, Hippocalcin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpcal1P62748 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpcal1P62748 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms