Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd3P62320 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms