Protein–RNA interactions for Protein: P62301

Rps13, 40S ribosomal protein S13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps13P62301 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps13P62301 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps13P62301 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps13P62301 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps13P62301 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps13P62301 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps13P62301 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps13P62301 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rps13P62301 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms