Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms