Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp46P62069 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp46P62069 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp46P62069 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp46P62069 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Usp46P62069 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp46P62069 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Usp46P62069 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Usp46P62069 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Usp46P62069 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp46P62069 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms