Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Tdrd6P61407 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Tdrd6P61407 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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Tdrd6P61407 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Tdrd6P61407 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Tdrd6P61407 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Tdrd6P61407 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Tdrd6P61407 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Tdrd6P61407 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Tdrd6P61407 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd6P61407 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd6P61407 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms