Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme3P61290 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme3P61290 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme3P61290 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme3P61290 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psme3P61290 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme3P61290 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psme3P61290 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms