Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ube2d1P61080 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2d1P61080 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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