Protein–RNA interactions for Protein: P61028

Rab8b, Ras-related protein Rab-8B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8bP61028 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab8bP61028 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms