Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ActbP60710 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ActbP60710 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ActbP60710 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ActbP60710 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ActbP60710 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ActbP60710 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ActbP60710 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ActbP60710 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ActbP60710 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ActbP60710 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ActbP60710 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ActbP60710 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ActbP60710 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ActbP60710 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ActbP60710 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ActbP60710 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ActbP60710 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ActbP60710 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ActbP60710 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ActbP60710 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ActbP60710 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ActbP60710 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ActbP60710 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ActbP60710 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ActbP60710 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ActbP60710 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ActbP60710 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ActbP60710 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ActbP60710 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ActbP60710 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ActbP60710 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ActbP60710 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ActbP60710 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ActbP60710 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ActbP60710 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ActbP60710 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ActbP60710 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ActbP60710 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ActbP60710 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ActbP60710 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ActbP60710 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ActbP60710 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ActbP60710 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ActbP60710 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ActbP60710 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ActbP60710 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ActbP60710 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ActbP60710 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ActbP60710 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ActbP60710 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ActbP60710 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ActbP60710 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ActbP60710 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ActbP60710 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ActbP60710 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ActbP60710 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ActbP60710 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ActbP60710 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ActbP60710 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ActbP60710 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ActbP60710 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ActbP60710 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ActbP60710 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ActbP60710 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ActbP60710 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ActbP60710 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ActbP60710 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ActbP60710 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ActbP60710 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ActbP60710 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ActbP60710 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ActbP60710 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ActbP60710 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ActbP60710 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ActbP60710 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ActbP60710 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ActbP60710 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ActbP60710 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ActbP60710 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ActbP60710 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ActbP60710 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ActbP60710 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ActbP60710 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ActbP60710 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ActbP60710 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ActbP60710 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ActbP60710 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ActbP60710 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ActbP60710 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ActbP60710 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ActbP60710 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ActbP60710 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ActbP60710 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ActbP60710 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ActbP60710 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ActbP60710 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
ActbP60710 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ActbP60710 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ActbP60710 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms